Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF641Q96N77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF641Q96N77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF641Q96N77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms