Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF578Q96N58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF578Q96N58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF578Q96N58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms