Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FGD4Q96M96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD4Q96M96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms