Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC74BQ96LY2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74BQ96LY2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms