Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNIP3Q96KP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNIP3Q96KP6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms