Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF6Q96J87 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF6Q96J87 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CELF6Q96J87 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms