Protein–RNA interactions for Protein: Q96IR7

HPDL, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPDLQ96IR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPDLQ96IR7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPDLQ96IR7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPDLQ96IR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPDLQ96IR7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms