Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL29Q96CT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL29Q96CT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms