Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3Q96C92 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCCAG3Q96C92 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms