Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TP53INP1Q96A56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TP53INP1Q96A56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP53INP1Q96A56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms