Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFKQ969G6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFKQ969G6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFKQ969G6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFKQ969G6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFKQ969G6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFKQ969G6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFKQ969G6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms