Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS3Q969F9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS3Q969F9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HPS3Q969F9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms