Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFRSF25Q93038 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFRSF25Q93038 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms