Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP13Q92995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP13Q92995 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP13Q92995 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP13Q92995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP13Q92995 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP13Q92995 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP13Q92995 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP13Q92995 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP13Q92995 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP13Q92995 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP13Q92995 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP13Q92995 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP13Q92995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP13Q92995 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP13Q92995 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP13Q92995 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP13Q92995 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP13Q92995 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP13Q92995 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP13Q92995 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP13Q92995 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP13Q92995 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP13Q92995 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP13Q92995 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP13Q92995 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP13Q92995 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP13Q92995 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP13Q92995 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP13Q92995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP13Q92995 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP13Q92995 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP13Q92995 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP13Q92995 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP13Q92995 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP13Q92995 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP13Q92995 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP13Q92995 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP13Q92995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP13Q92995 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP13Q92995 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP13Q92995 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP13Q92995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP13Q92995 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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