Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNRQ92752 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNRQ92752 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNRQ92752 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TNRQ92752 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNRQ92752 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNRQ92752 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNRQ92752 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNRQ92752 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TNRQ92752 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNRQ92752 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNRQ92752 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNRQ92752 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNRQ92752 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNRQ92752 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNRQ92752 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNRQ92752 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNRQ92752 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNRQ92752 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNRQ92752 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNRQ92752 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNRQ92752 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNRQ92752 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNRQ92752 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNRQ92752 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNRQ92752 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNRQ92752 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNRQ92752 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNRQ92752 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNRQ92752 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNRQ92752 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNRQ92752 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNRQ92752 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNRQ92752 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNRQ92752 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNRQ92752 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNRQ92752 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNRQ92752 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TNRQ92752 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNRQ92752 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNRQ92752 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNRQ92752 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNRQ92752 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNRQ92752 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNRQ92752 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNRQ92752 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNRQ92752 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNRQ92752 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNRQ92752 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TNRQ92752 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNRQ92752 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNRQ92752 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNRQ92752 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNRQ92752 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNRQ92752 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TNRQ92752 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TNRQ92752 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNRQ92752 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNRQ92752 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNRQ92752 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNRQ92752 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNRQ92752 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNRQ92752 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNRQ92752 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNRQ92752 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms