Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDRG1Q92597 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDRG1Q92597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDRG1Q92597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDRG1Q92597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms