Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUFY2Q8WXA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUFY2Q8WXA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RUFY2Q8WXA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms