Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCA10Q8WWZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ABCA10Q8WWZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ABCA10Q8WWZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
ABCA10Q8WWZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCA10Q8WWZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCA10Q8WWZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCA10Q8WWZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCA10Q8WWZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCA10Q8WWZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms