Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKA2Q8WVK7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKA2Q8WVK7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKA2Q8WVK7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms