Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC12Q8WUD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC12Q8WUD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms