Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3RF2Q8TEC5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3RF2Q8TEC5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms