Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIN3Q8TB24 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIN3Q8TB24 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIN3Q8TB24 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms