Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDCSPQ8NFU4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FDCSPQ8NFU4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDCSPQ8NFU4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDCSPQ8NFU4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms