Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCPH1Q8NEM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCPH1Q8NEM0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms