Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
TDRD9Q8NDG6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
TDRD9Q8NDG6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TDRD9Q8NDG6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TDRD9Q8NDG6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.94■■■■■ 4.15
TDRD9Q8NDG6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TDRD9Q8NDG6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TDRD9Q8NDG6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TDRD9Q8NDG6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TDRD9Q8NDG6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TDRD9Q8NDG6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms