Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APCDD1LQ8NCL9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms