Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMKVQ8NCB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAMKVQ8NCB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAMKVQ8NCB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms