Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCO5AQ8N6Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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