Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF2Q8N3S3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF2Q8N3S3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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