Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
VPS8Q8N3P4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
VPS8Q8N3P4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
VPS8Q8N3P4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
VPS8Q8N3P4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms