Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA13Q8N1Q1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CA13Q8N1Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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CA13Q8N1Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CA13Q8N1Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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