Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC47Q8N1G4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC47Q8N1G4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 879.5 ms