Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA5Q8N114 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHISA5Q8N114 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHISA5Q8N114 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms