Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN12Q8IYM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLFN12Q8IYM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN12Q8IYM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms