Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC117Q8IWD4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms