Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSRQ86X29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSRQ86X29 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSRQ86X29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms