Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRX1Q86UT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRX1Q86UT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRX1Q86UT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRX1Q86UT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms