Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM135Q86UB9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM135Q86UB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM135Q86UB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM135Q86UB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms