Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PBRM1Q86U86 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PBRM1Q86U86 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
PBRM1Q86U86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.1
PBRM1Q86U86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PBRM1Q86U86 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PBRM1Q86U86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms