Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC29A4Q7RTT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC29A4Q7RTT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC29A4Q7RTT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC29A4Q7RTT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms