Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP45Q70EL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP45Q70EL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP45Q70EL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP45Q70EL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms