Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEND4Q6ZU67 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BEND4Q6ZU67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BEND4Q6ZU67 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BEND4Q6ZU67 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms