Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC55Q6ZSA7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC55Q6ZSA7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms