Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNI2Q6ZMN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms