Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCBE1Q6UXH8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCBE1Q6UXH8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCBE1Q6UXH8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms