Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TXNDC11Q6PKC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC11Q6PKC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC11Q6PKC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms