Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL35Q6PF15 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL35Q6PF15 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL35Q6PF15 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL35Q6PF15 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms