Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN13Q6MZZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN13Q6MZZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN13Q6MZZ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms