Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RCSD1Q6JBY9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RCSD1Q6JBY9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms