Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TXNDC8Q6A555 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNDC8Q6A555 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNDC8Q6A555 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms